Para o Rio Preto, 2012 começou com uma bem. O tabu contra o arquirrival América se manteve. Desde 2009, o time não perde o dérbi para o Rubro. A vitória de 3 a 0, na segunda rodada da Série A2 do Campeonato Paulista, deu esperanças lado verde e branco de São José do Rio Preto.

Mas, depois de cinco jogos na competição, o time esmeraldino acumulava quatro derrotas e apenas uma vitória. Com os resultados, a equipe ficou na zona de rebaixamento. Mais do que isso, a pressão da torcida deixou elenco e comissão técnica mais nervosos para sequência.

A segunda vitória só veio na nona rodada, contra a Esportiva Santacruzense, já com técnico novo. Play Freitas assumiu o lugar de André Oliveira.

Foram só cinco vitórias em 19 jogos. Dois dos triunfos foram consecutivos e fizeram o time respirar na competição. Bastava uma vitória na última rodada, para o Jacaré se manter na Série A2 do Campeonato Paulista, mas a equipe acabou derrotada em casa para o Velo Clube por 4 a 0 e foi rebaixada.

No segundo semestre, o Rio Preto deixou de lado as atividades dentro de campo para se preparar para 2013, ano que disputará a Série A3 do Campeonato Paulista.