Quando Wart é derrotado no final do jogo em Super Mario Bros. 2, Mario é mostrado, sonhando em sua cama. Por causa disso, presume-se que nada foi real. Basicamente, tudo indica que a aventura é invenção da cabeça de Mario.

A versão beta do jogo possui um final diferente. Ao contrário do jogo original, o beta não mostra Mario sonhando. Provavelmente, isso é resultado do final de Doki Doki Panic que foi usado e não inclui a adição encontrada em Super Mario Bros. 2.